Das ZZF ist seit 2009 Mitglied der Leibniz-Gemeinschaft und damit vom Bund und den Ländern gemeinsam finanziert. Bereits seit 1996 ist rechtlich als eingetragener Verein mit Sitz in Potsdam institutionalisiert. In der Satzung des ZZF ist auch die Gremienstruktur festgelegt. Zu den Organen zählen neben dem Vorstand die Mitgliederversammlung, das Kuratorium und der Wissenschaftliche Beirat.
Die Forschung und der Wissenstransfer des ZZF ist in der Direktion und den ihr zugeordneten Bereichen sowie in fünf Abteilungen angesiedelt: Abt. I: Kommunismus und Gesellschaft, Abt. II: Wissen – Wirtschaft – Politik, Abt. III: Medien- und Informationsgesellschaft, Abt. IV: Regime des Sozialen und Abt. V: Globalisierungen in einer geteilten Welt.
Die Interessenvertretung aller am Haus Beschäftigten und der assoziierten Kolleginnen und Kollegen nimmt ein Betriebsrat wahr. Die Wahl des aktuellen dreiköpfigen Betriebsrats erfolgte 2021.
Ein Förderverein unterstützt zudem die Arbeit des ZZF: Der Verein der Freunde und Förderer des ZZF Potsdam finanziert an der Schnittstelle von Kultur und Wissenschaft u. a. Veranstaltungen des Instituts mit, die Ergebnisse der zeithistorischen Forschung in die Öffentlichkeit kommunizieren.
Einen guten Überblick über die Institutsstrukturen erhalten Sie im Organigramm des ZZF.